ABSTRACT Objective: To report a rare case of a patient with a molecular diagnosis of Kleefstra syndrome (KS) who has four other chromosomal alterations involving pathogenic variants. Case description: Male patient, two years old, with global delay, including in neuropsychomotor development, ocular hypertelorism, broad forehead, brachycephaly, hypotonia, ligament laxity, unilateral single palmar crease and arachnoid cyst. The microarray-based comparative genomic hybridization (a-CGH) identified copy number variations (CNVs) in five regions: 9q34.3, 6p22.1, Yq11.223, Yp11.23, and 2q24.1. The heterozygous microdeletion in 9q34.3 involving the EHMT1 gene confirms the diagnosis of KS. Comments: The presence of pathogenic CNVs and/or those of uncertain significance, located on chromosomes 2, 6 and Y, may be contributing to a variability in the patient's clinical condition (arachnoid cyst, single palmar fold and ligament laxity), compared to other individuals with only KS genetic alteration, making the dignosis of the disease harder.

RESUMO Objetivo: Relatar um caso raro de paciente com diagnóstico molecular de síndrome de Kleefstra (SK) que apresenta quatro outras alterações cromossômicas envolvendo variantes patogênicas. Descrição do caso: Paciente masculino, dois anos de idade, com atraso global de desenvolvimento neuropsicomotor, hipertelorismo ocular, fronte ampla, braquicefalia, hipotonia, frouxidão ligamentar, prega palmar única unilateral e cisto aracnoide. Exame de hibridização genômica comparativa (a-CGH) identificou variações de número de cópias (CNV) em cinco regiões: 9q34.3, 6p22.1, Yq11.223, Yp11.23 e 2q24.1. A microdeleção heterozigótica em 9q34.3 confirma o diagnóstico de síndrome de Kleefstra. Comentários: A presença das CNV patogênicas e/ou de significado incerto, localizadas nos cromossomos 2, 6 e Y, pode estar contribuindo para uma variabilidade no quadro clínico do paciente (cisto aracnoide, prega palmar única e frouxidão ligamentar) em relação a outros indivíduos somente com alteração genética da SK, dificultando o diagnóstico da doença.

ABSTRACT Objective: Autism spectrum disorder (ASD) affects cognitive development and social interaction on different levels. Genetic and environmental factors are associated with secondary ASD. Genetic inheritance is mainly polygenic, and 10% are copy number variations (CNVs). Array comparative genomic hybridization (array-CGH) is used to identify CNVs. This report aimed to discuss autism spectrum disorder and its diagnosis by array comparative genomic hybridization, highlighting the association with the pathogenic duplication of 17q12q21.2. Case description: A male baby was born at 37 weeks’ gestation by cesarean section. The child showed strabismus, cryptorchidism, hypertelorism, frontal bossing, and developmental delay, walking at 25 months and talking at 4 years. At the age of 2 years, array-CGH of peripheral blood revealed a 5.6-Mb 17q12q21.2 duplication or arr 17q12q21.2 (34,815,527-40,213.109)x3 encompassing 190 genes, including HNF-1B and LHX1. The child was clinically diagnosed with ASD. Comments: Changes in the 17q12 segment, such as the duplication found, have been associated with the development of several problems in previous studies, mainly kidney diseases and behavioral disorders. Located at this chromosome region, HNF1's homeobox B codes a member of the superfamily containing homeodomain of transcription factors. Another gene associated with abnormalities in neurological development regarding 17q12 deletions is LHX1, as shown in this case study. LHX1 plays a role in the migration and differentiation of GABA neurons, modulating the survival of pre-optical interneurons, thus affecting cellular migration and distribution in the cortex. Changes in this control result in flaws in interneuron development, contributing to the pathophysiology of psychiatric diseases.

RESUMO Objetivo: O transtorno do espectro autista (TEA) afeta o desenvolvimento cognitivo e a interação social em diferentes níveis. Fatores genéticos e ambientais estão associados a TEA secundário. A herança genética é principalmente poligênica e, em 10%, são variações do número de cópias (CNV). A hibridização genômica comparativa de array (array-CGH) é usada para identificar CNV. Este relato objetivou discutir o TEA e seu diagnóstico por array-CGH, destacando a associação com a duplicação patogênica do 17q12q21.2. Descrição do caso: Um bebê do sexo masculino nasceu com 37 semanas de gestação por cesariana. A criança apresentou atraso no desenvolvimento, andando aos dois anos e um mês e falando aos quatro, exibindo estrabismo, criptorquidia, hipertelorismo e saliência frontal. Aos dois anos, o array-CGH de sangue periférico revelou duplicação de 5,6 Mb 17q12q21.2 ou arr 17q12q21.2 (34.815.527-40.213.109) x3 abrangendo 190 genes, incluindo HNF1B e LHX1. A criança foi clinicamente diagnosticada com TEA. Comentários: Alterações no segmento 17q12, como a duplicação encontrada, têm sido associadas ao desenvolvimento de patologias renais e distúrbios comportamentais. Localizado nessa região cromossômica, o HNF1B codifica um membro da superfamília que contém o domínio dos fatores de transcrição. Outro gene foi associado a anormalidades neurológicas, em relação às deleções 17q12, o LHX1, como mostrado neste caso. O LHX1 desempenha um papel na migração e diferenciação dos neurônios GABA, modulando a sobrevivência dos interneurônios pré-ópticos e afetando, assim, a migração e distribuição celular no córtex. Mudanças nesse controle resultam em falhas no desenvolvimento dos interneurônios, contribuindo para a fisiopatologia das doenças psiquiátricas.

ABSTRACT A total of 1.67 million breast cancer cases per year are reported worldwide. Of these, 5%–10% are caused by inherited mutations. Phenocopy is a rare phenomenon, with only a few cases reported in the literature. In phenocopies, phenotypes identical to those with genetic origin occur because of environmental factors rather than familial mutations. We describe a case of phenocopy in a 44-year-old female patient with triple-negative breast cancer. The mother and sister wee heterozygous for c.1813delA, p.Ile605TyrfsTer9 in BRCA2 . The patient underwent genetic testing for BRCA1 and BRCA2 and exome sequencing. Familial or other cancer variants were not detected. The most accepted phenocopy theory is that patients without genetic variants but who are carriers of these mutations undergo cellular changes due to environmental factors, increasing the risk of breast cancer. Therefore, the detection of phenocopy in patients with breast cancer is important in clinical practice.

Resumo Objetivo Verificar a eficácia da profilaxia de curto prazo para o parto vaginal ou cesáreo com inibidor de C1 derivado de plasma concentrado em mulheres grávidas. Eles devem ter angioedema hereditário e inibidor normal de C1 no plasma. Métodos Relato de caso de gestantes diagnosticadas com angioedema hereditário com inibidor de C1 normal que foram tratadas com inibidor intravenoso de concentrado de C1 para profilaxia de ataques de angioedema quando hospitalizadas para o parto. O exon 9 do gene de genotipagem do fator 12 (F12) foi realizado por sequenciamento automático em todos os pacientes. Resultados Três casos de gestantes com angioedema hereditário com nível sérico normal de inibidor de C1 são relatados. O teste genético detectou a presença de uma mutação patogênica no gene F12. Os partos ocorreram sem intercorrências e as pacientes não apresentaram sintomas hereditários de angioedema nas 72 horas seguintes. Conclusão O concentrado de inibidor de C1 pode ser útil para prevenir ataques de angioedema durante e após o parto.

Abstract Objective To verify the efficacy of short-term prophylaxis for vaginal or cesarean section childbirth with plasma-derived C1-inhibitor concentrate in pregnant women. They should have hereditary angioedema (HAE) and normal plasma C1-inhibitor. Methods Case report of pregnant women diagnosed with HAE with normal C1- inhibitor who had been treated with intravenous C1-inhibitor concentrate for prophylaxis of angioedema attacks when hospitalized for delivery. The exon 9 of the Factor 12 (F12) genotyping gene was performed by automatic sequencing in all patients. Results Three cases of pregnant women with HAE with normal serum level of C1- inhibitor are reported. The genetic test detected the presence of a pathogenic mutation in the F12 gene. Deliveries occurred uneventfully and patients had no HAE symptoms in the following 72 hours. Conclusion C1-inhibitor concentrate could be useful to prevent angioedema attacks during and after delivery.

RESUMO OBJETIVO Investigar a presença das mutações no gene Angiopoietina (ANGPT1) e gene Plasminogênio (PLG) em pacientes com Angioedema Hereditário (AEH) com inibidor C1 esterase (C1-INH) normal e negativos para mutação do gene F12. MÉTODOS Foram avaliados pacientes com diagnóstico clínico de AEH sem deficiência ou disfunção de C1-INH e negativos para mutação do gene F12. Realizou-se extração, quantificação e diluição do DNA a uma concentração de 100 ng/uL, em seguida amplificação do DNA (PCR) para avaliação molecular do exon 2 do gene ANGPT1 e do exon 9 do gene PLG para identificação das mutações c.807G>T.p.A119S e c.988A>G p.K330E, respectivamente. O produto da PCR foi avaliado em eletroforese em gel de agarose 1%. Foi realizado o sequenciamento pelo método de Sanger. As análises dos eletroferogramas foram realizadas pelo programa FASTA®. RESULTADOS Foram sequenciadas amostras de 15 mulheres, idade entre 10 e 60 anos, com níveis séricos de inibidor de C1 esterase e C4 normais variando de 22 a 39mg/dL e 10 a 40mg/dL, respectivamente. Não foram identificadas mutações nos éxons analisados dos genes ANGPT1 e PLG. Entretanto no gene PLG foram encontrados polimorfismo de nucleotídeo único (SNP), em duas pacientes homozigotas e cinco heterozigotas. CONCLUSÃO Mais estudos sobre SNP são necessários para esclarecer estes achados pois eles podem ser utilizados como marcadores moleculares do AEH e alvo para novos tratamentos.

SUMMARY OBJECTIVE To investigate the presence of the Angiopoietin 1 (ANGPT1) and Plasminogen (PLG) mutations in patients with Hereditary Angioedema (HAE) and normal C1 esterase inhibitor (C1-INH) levels, who do not harbor the F12 gene mutation. METHODS Patients clinically diagnosed with HAE but without C1-INH deficiency or dysfunction and F12 gene mutation were evaluated. DNA extraction, quantification, and dilution were performed at a concentration of 100 ng/µL, followed by a DNA amplification (PCR) for molecular evaluation of exon 2 of the ANGPT1 gene and exon 9 of the PLG gene for identification of mutations c.807G>T / p.A119S and c.988A>G / p.K330E, respectively. The PCR product was evaluated in 1% agarose gel electrophoresis. Sequencing was performed using the Sanger method. The electropherograms were analyzed using the FASTA® program. RESULTS DNA samples from 15 women were sequenced. Their ages ranged from 10 to 60 years and the normal C1 esterase and C4 inhibitor serum levels ranged from 22 to 39 mg/dL and from 10 to 40 mg/dL, respectively. No mutations were detected in the analyzed exons of ANGPT1 and PLG. However, a single-nucleotide polymorphism (SNP) was detected in two homozygotic and five heterozygotic patients. CONCLUSION Further studies are needed to evaluate these SNPs and scrutinize their potential for use as molecular markers of HAE and as novel therapeutic targets.

RESUMO Objetivo: Verificar a relação dos polimorfismos do gene do receptor de vitamina D (RVD) com sinais clínicos e níveis de vitamina D (VD) em asmáticos. Métodos: Estudo transversal com 77 crianças de 7 a 14 anos de um ambulatório especializado, divididas em 3 grupos: asmáticos, em uso de corticoide inalatório (ICS) por mais de um ano; asmáticos sem necessidade de ICS; não asmáticos e não alérgicos (de acordo com o International Study of Asthma and Allergies in Childhood - ISAAC. Foram avaliados: espirometria, testes alérgicos, presença do polimorfismo CDX2 do promotor do RVD por reação em cadeia da polimerase (PCR) e genotipagem de polimorfismos dos éxons 2 e 3 por PCR-SSCA (single-strand conformational analysis), imunoglobulina E (IgE) total e IgE específica para ácaros e gramíneas nos três grupos estudados. Níveis de 25-hidroxivitamina D foram dosados nos asmáticos. Resultados: A média de idade foi 10,8±2,2 anos, 57% masculinos, 38 asmáticos com ICS, 22 sem ICS e 17 não asmáticos. Rinite alérgica esteve presente em 90% dos asmáticos, polimorfismo CDX2 em 23% dos asmáticos e ausente nos controles (p=0,03). Menores níveis de volume expiratório forçado no primeiro segundo (VEF1%) foram observados nos asmáticos homozigotos para CDX2 (p=0,001). Variações nas sequências dos éxons 2 e 3 não foram relacionadas com a asma ou demais testes. Deficiência ou insuficiência de VD foi diagnosticada em 98% dos asmáticos. Não houve associação entre níveis de VD e polimorfismos genéticos dos éxons 2 e 3. Conclusões: Observou-se associação positiva entre polimorfismo CDX2 em homozigoze com asma e menores valores de VEF1%. O CDX2 pode modificar a interação celular do RVD com a vitamina, bem como pode estar associado com a asma e com a dificuldade de controle da doença.

ABSTRACT Objective: To verify the relationship between polymorphisms of the vitamin D receptor gene (VDR), clinical findings, and serum vitamin D (VD) levels in asthmatics. Methods: A cross sectional study of 77 children aged 7 to 14 years old, who were attended at a specialized clinic. The children were divided into 3 groups: asthmatics who had been using inhaled corticosteroids (ICS) for more than one year; asthmatics who had not been using ICS; non-asthmatics, and children without allergies (according to the International Study of Asthma and Allergies in Childhood - ISAAC). Spirometry, skin prick tests, the presence of a VDR promoter CDX2 polymorphism from an allele-specific polimerase chain reaction (PCR), exons 2 and 3 polymorphisms genotyping by PCR-SSCA (single-strand conformational analysis), total immunoglobulin E (IgE) and specific IgE to mites and grass were evaluated in these three groups. Levels of 25-hydroxyvitamin D were determined in asthmatics only. Results: The mean age of the children was 10.8±2.0 years old, 57% were male, 38 were asthmatic and using ICS, 22 were asthmatic and not using ICS, and 17 were non-asthmatic. Allergic rhinitis was present in 90% of asthmatics. Homozygous CDX2 was detected in 23% of the patients and absent in the control group (p=0.03). Lower forced expiratory volume in 1 second (FEV1%) values were observed in CDX2 homozygous asthmatics (p=0.001). Variations in the exon 2 and 3 sequences were not related to asthma or the other tests. VD deficiency or insufficiency was detected in 98% of asthmatics. There was no association between VD levels and genetic polymorphisms from exons 2 and 3. Conclusions: There was a positive association between homozygous CDX2 polymorphism, asthma and lower FEV1% values. CDX2 is capable of modifying cell interaction between VDR and VD, and it could be associated with the prevalence of asthma, and the difficulty in controlling the disease.

Observações à microscopia eletrônica e estudos bioquímicos de cromossomos e núcleos sem histonas tem suportado a hipótese que o DNA de eucariotos é organizado em alças associadas com o esqueleto cromossômico ou à matriz nuclear. A observação da matriz nuclear sem a remoção do DNA, através da digestão com enzimas de restrição, apresenta uma figura em halo que representa a liberação das alças de DNA. Um protocolo para a obtenção de halos nucleares de núcleos politênicos de insetos, através da extração de proteínas usando o detergente LIS, é reportado nesse trabalho. Foram realizadas análises utilizando-se microscopia de fluorescência e microscopia de varredura confocal a laser. A extração de halos nucleares foi possível somente com o isolamento da fração nuclear em tampão sem espermina e espermidina. A obtenção de halos nucleares de núcleos politênicos de glândula salivar de Bradysia hygida contribui significativamente para o estudo da estrutura e função dessas organelas tão especiais.

A protocol for recovered nuclear halos from insect polytene nuclei after the extraction of the nuclear proteins using LIS detergent is reported in this work. Analysis was carried out using fluorescence and confocal laser scan microscopy. The extraction of nuclear halos was possible only with nuclei-fraction isolation in hypotonic buffer without spermine and spermidine. The recovered nuclear halos from Bradysia hygida salivary gland polytene nuclei, contributed greatly to the study of the structure and function of these special organelles.